Cientistas confirmaram uma nova estrutura de DNA dentro de células humanas

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A descoberta do que é descrito como um “nó torcido” de DNA em células vivas confirma que nosso complexo código genético é trabalhado com uma simetria mais complexa do que a estrutura de hélice dupla que todos associam ao DNA. É importante ressaltar que as formas dessas variantes moleculares afetam o funcionamento de nossa biologia.

“Quando a maioria de nós pensa em DNA, pensamos na dupla hélice”, disse o pesquisador de anticorpos terapêuticos Daniel Christ, do Instituto Garvan de Pesquisa Médica, na Austrália, em abril, quando a descoberta foi feita.

“Esta nova pesquisa nos lembra que estruturas de DNA totalmente diferentes existem – e poderiam ser importantes para nossas células.”

O componente de DNA identificado pela equipe é chamado de estrutura de motivo intercalado (i-motif), descoberta pelos pesquisadores na década de 1990, mas até agora só tinha sido testemunhada in vitro e não em células vivas.

Graças à equipe de Christ, sabemos agora que o i-motif ocorre naturalmente nas células humanas, o que significa que a importância da estrutura para a biologia celular – que já foi questionada anteriormente, dado que só foi demonstrado em laboratório – exige nova atenção dos pesquisadores.

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(Zeraati et al., Nat Chem, 2018)

Se a sua única familiaridade com as formas de DNA é a espiral helicoidal dupla tornada famosa por Watson e Crick, a configuração do motivo intercalado pode ser uma surpresa.

“O i-motif é um ‘nó’ de quatro filamentos de DNA”, explicou o genomalista Marcel Dinger, que liderou a pesquisa.

“Na estrutura do nó, letras C [citosina] na mesma cadeia de DNA se ligam – então isso é muito diferente de uma hélice dupla, onde ‘letras’ em cadeias opostas se reconhecem, e onde Cs se liga a Gs [guaninas]. “

De acordo com Mahdi Zeraati de Garvan, o primeiro autor do novo estudo, o i-motif é apenas uma das várias estruturas de DNA que não tomam a forma de dupla hélice – incluindo A-DNA, Z-DNA, triplex DNA e Cruciform DNA – e que também pode existir em nossas células.

Outro tipo de estrutura de DNA, chamado DNA G-quadruplex (G4), foi visualizado pela primeira vez por pesquisadores em células humanas em 2013, que fizeram uso de um anticorpo manipulado para revelar o G4 dentro das células.

No estudo de abril, Zeraati e colegas pesquisadores empregaram o mesmo tipo de técnica, desenvolvendo um fragmento de anticorpo (chamado iMab) que poderia especificamente reconhecer e se ligar ao i-motif.

Ao fazê-lo, destacou sua localização na célula com um brilho imunofluorescente.

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Impressão do artista, sobreposta na imagem do anticorpo iMab (verde) no núcleo das células (Chris Hammang).

“O que mais nos animou é que pudemos ver os pontos verdes – os i-motif – aparecendo e desaparecendo com o tempo, então sabemos que eles estão se formando, se dissolvendo e se formando novamente”, disse Zeraati .

Embora ainda haja muito o que aprender sobre o funcionamento da estrutura do i-motif, as descobertas indicam que os transitórios i-motifs geralmente se formam tarde no “ciclo de vida” de uma célula – especificamente chamada fase G1 tardia, quando o DNA está sendo “lido” ativamente .

Os i-motifs também tendem a aparecer nas regiões conhecidas como “promotoras” – áreas de DNA que controlam se os genes são ativados ou desativados – e nos telômeros, marcadores genéticos associados ao envelhecimento.

“Nós achamos que o ir e vir dos i-motifs é uma pista para o que eles fazem”, disse Zeraati .

“Parece provável que eles estejam lá para ajudar a ligar ou desligar genes, e para afetar se um gene é lido ativamente ou não.”

Agora que sabemos definitivamente que essa nova forma de DNA existe nas células, isso dará aos pesquisadores um mandato para descobrir exatamente o que essas estruturas estão fazendo dentro de nossos corpos.

Como Zeraati explica, as respostas podem ser relevantes – não apenas para o i-motif, mas também para o DNA-A, DNA-Z, DNA triplex e DNA cruciforme.

“Essas conformações de DNA alternativas podem ser importantes para que as proteínas da célula reconheçam sua sequência cognata de DNA e exerçam suas funções regulatórias”, explicou Zeraati ao ScienceAlert.

“Portanto, a formação dessas estruturas pode ser de extrema importância para a célula funcionar normalmente. E qualquer aberração nessas estruturas pode ter consequências patológicas.” [ScienceAlert]

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